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电子商务中的任何一笔交易，都包含信息流、商流、资金流和物流。
赛迪顾问高级咨询师迟聪冰分析认为，目前电子商务的发展主要有3个瓶颈：支付、物流，还有信用。网上可以解决信息流、商流、资金流等商品流通的大部分问题，但却无法解决物流问题。专家认为，在电子商务的发展过程中，物流瓶颈不容忽视和回避，能否有效解决物流问题很大程度上决定了电子商务发展的空间。
禁锢在物流中的困兽
由于我国的物流发展起步晚、水平低，现行的物流体系很大程度制约着电子商务的发展。其主要表现为电子商务的认识仅局限于信息流、商流和资金流的电子化，忽视物流的电子化过程;流基础设施不完善、管理技术落后、统储运的体制和手段阻碍现代物流的发展、三方物流服务发展滞后以及电子商务发展的物流体系尚未建立。
在国外被证明成功的模式移植到中国能否成功，在多年前已被证实过不可行或可行性相对差。其主要原因是中国尚显落后的快递业以及用户对邮购方式的不认同，直接导致了物流成为当前中国传统电子商务所面临的最难以逾越的鸿沟。数据显示，中国网民和国外网民在网上购物方面最大的区别就是信用卡使用率不高，尽管各大银行的发卡率增长迅速，但直到现在，中国仍然有70%的网民选择货到付款，物流上的制约成为很长一段时间内令中国电子商务厂商头疼的问题。
“必须要完善物流配送体系，大力发展现代化物流，才能进一步推广电子商务，充分发挥电子商务的跨时域优势。”支付宝市场部负责人介绍，“目前电子商务化物流体系正在形成当中，已具备实战能力。”
第三方物流联盟效果明显
中国电子商务要想取得持续发展，必须解决物流这个大障碍。对于传统电子商务网站，只有在物流环节形成强大的“物流联盟”，以支撑起整个电子商务产业的物流体系，也许才是突破瓶颈的真正出路。
所谓物流联盟，是指电子商务网站以及邮政、快递等物流企业组成的物流产业链，电子商务网站在其中扮演产业链的催生及带动者，对目前物流资源进行合理而高效的整合与利用。
作为当前国内最大的网上安全交易服务提供商，支付宝率先引入物流合作，于2005年6月，与天津大田集团和宅急送成立了我国第一个电子商务第三方物流联盟，11月又增加了亚风快递，解决物流瓶颈，打造适合电子商务发展的现代化物流模式，为安全支付和交易再添砝码。
“对于物流与电子商务公司来讲，将达到双赢。”支付宝相关负责人认为，支付宝日交易的飞速增加，也帮助物流商本身挺进了更广阔的市场，促进了物流公司的现代化发展。
保障买卖双方利益
据介绍，我国的网民目前约1.23亿人，从1998年3月第一笔网上银行进行的电子支付交易成功开始，这项业务发展十分迅猛，2004年电子支付交易额约74亿元人民币，2005年便增到160多亿元。网上支付手段开始为更多的人所接受。
但是安全和物流方面的问题仍然让网民对网上支付持“观望态度”。一份来自美国eMarketer的2005年分析报告指出，网民对于银行卡网上支付的安全性依旧持不信任的态度，以及产品配送的物流问题，都是电子商务发展面临的瓶颈。
2005年支付宝率先喊出“你敢用，我就敢赔”的口号，支付宝的“全额赔付”是，如果在成交协议后，卖家没有向买家寄送货品或者买家收到的物品与描述不符，淘宝作为第三方监管将为买家提供与货品价值等额的“全额赔付”，同时保障了买家和卖家的利益。
整合物流之后，支付宝在“全额赔付”制度的基础上，又推出“推荐物流赔付制度”，在支付宝交易过程中，卖家在交易中直接使用支付宝系统下订单的方式选择推荐物流服务，将享有支付宝与推荐物流公司协定的相应理赔内容：对于物品在运输过程中的遗失、破损，及非本人签收给客户造成的损失，都能得到相应的赔偿。买卖双方的利益得到了保障。