《保税区检验检疫监督管理办法》自2005年3月1日起施行。
第一章总 则
第一条 为加强和规范保税区检验检疫监督管理工作，促进国家经济贸易的快速健康发展，根据《中华人民共和国进出口商品检验法》及其实施条例、《中华人民共和国进出境动植物检疫法》及其实施条例、《中华人民共和国国境卫生检疫法》及其实施细则、《中华人民共和国食品卫生法》及其他有关法律法规，制定本办法。
第二条 本办法适用于对进出保税区，法律法规规定应当实施检验检疫的货物及其包装物、铺垫材料、运输工具、集装箱（以下简称应检物）的检验检疫及监督管理工作。
第三条 国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）统一管理全国保税区的检验检疫监督管理工作。国家质检总局设在保税区的出入境检验检疫机构（以下简称检验检疫机构），对进出保税区的应检物实施检验检疫和监督管理。
第四条 进出保税区的应检物需要办理检验检疫审批手续的，应当按照检验检疫法律法规的规定办理审批手续。
第五条 应检物进出保税区时，收发货人（货主）或者其代理人应当按照国家质检总局有关规定向检验检疫机构办理报检手续，检验检疫机构按照国家有关法律、法规、规章以及国家质检总局的规定实施检验检疫，海关凭检验检疫机构签发的货物通关证明验放。
第六条 检验检疫机构应当加强与海关的配合和协作，并按照简便、有效的原则对进出保税区的应检物实施检验检疫。
第二章输入保税区应检物的检验检疫
第七条 从境外进入保税区的应检物，属于卫生检疫范围的，由检验检疫机构实施卫生检疫；应当实施卫生处理的，由检验检疫机构进行卫生处理。
第八条 从境外进入保税区的应检物，属于动植物检疫范围的，由检验检疫机构实施动植物检疫，应当实施动植物检疫除害处理的，在检验检疫机构的监督下，依法进行除害处理。
第九条 检验检疫机构对从境外进入保税区的可以用作原料的固体废物、旧机电产品、成套设备实施检验和监管，对外商投资财产按照有关规定进行价值鉴定，对未办理通关手续的货物不实施检验。
第十条 保税区内企业从境外进入保税区的仓储物流货物以及自用的办公用品、出口加工所需原材料、零部件免予实施强制性产品认证。
第十一条 应检物从中华人民共和国境内非保税区（不含港澳台地区，以下简称非保税区）进入保税区时，不需要办理海关通关手续的，检验检疫机构不实施检验检疫；需要办理海关通关手续的，检验检疫机构应当按照规定对应检物实施检验检疫。
第三章输出保税区应检物的检验检疫
第十二条 从保税区输往境外的应检物，检验检疫机构依法实施检验检疫。
第十三条 从保税区输往非保税区的应检物，除法律法规另有规定的，不实施检疫。
第十四条 从保税区输往非保税区的应检物，属于实施食品卫生监督检验和商品检验范围的，检验检疫机构实施检验。对于集中入境分批出区的货物，可以分批报检，分批检验；符合条件的，可以于入境时集中报检，集中检验，经检验合格的出区时分批核销。
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